El gobierno federal excedió mil 200 por ciento del presupuesto destinado para "Gastos de Seguridad Pública y Nacional". Entre 2013 y 2016, el gobierno federal destinó un total de 2 mil 913 millones de pesos, sin embargo, se gastaron 32 mil 707 millones más de la cantidad solicitada por el ejecutivo y aprobada cada año por la Cámara de Diputados en el Presupuesto de Egresos. Con motivo de su quinto informe de gobierno, Enrique Peña Nieto respondió a las preguntas parlamentarias que le formuló la Cámara de Diputados, en las que señaló que las instituciones del gabinete de seguridad utilizaron los recursos para atender "investigaciones especiales, operativos y acciones relacionadas con la generación de inteligencia que implican riesgo, urgencia y confidencialidad". El presidente señaló que, en el esquema tradicional de planeación del gasto público, estas acciones no pueden ser previstas. Afirmó que no es discrecional el uso de esos recursos y en cualquier caso, está sujeto a la fiscalización de la ASF. Diputados federales de Morena fueron quienes cuestionaron el gasto total de 35 mil 621 millones ejercidos en la partida 33701 (Gastos de Seguridad Pública y Seguridad Nacional) que representa un sobreejercicio de mil 200 por ciento respecto al presupuesto aprobado para el periodo 2013-2016. A esta partida, la Cámara de Diputados en el 2013 autorizó 834 millones de pesos, pero el Ejecutivo ejerció 3 mil 986 millones; en 2014 le aprobaron 723 millones y se reportó un gasto de 9 mil 534 millones; en el 2015 le asignaron 561 millones y utilizó 8 mil 546 millones; y en el 2016 dio 407 millones, pero la cantidad, de nueva cuenta fue rebasada, y se gastaron 9 mil 325 millones. La Secretaría de Gobernación, la Marina, la PGR, la Sedena y la Oficina de la Presidencia de la República fueron las instituciones que registraron un mayor incremento de gasto, según Milenio.